یکی از ایراداتی که همواره به بانک ملی گرفته می‌شود، موضوع بنگاه‌داری این بانک است. شرکت‌های زیرمجموعه بانک ملی بسیار زیاد است که در جای خود قابل بررسی است، ولی یکی از مهمترین زیرمجموعه‌های این شرکت که اتفاقا باعث دردسر زیاد بانک ملی در خصوص بنگاه‌داری شده، همین شرکت سرمایه‌گذاری توسعه ملی است.